دو سال پیش زمانی که کلود استرایف و دوستانش نقشه سپیروث را برای سقوط یک شهاب سنگ عظیم به زمین شکست دادند، جهان برای همیشه تغییر کرد. با این حال، پیروزی آنها بهای زیادی را به همراه داشت، زیرا شهر شلوغ میدگار ویران شده بود. خوشبختانه، شهروندان زنده‌مانده خانه جدیدی به نام Edge ایجاد کردند. Advent Children به تلاش های Cloud و Tifa برای ایجاد زندگی جدیدی برای خود و همشهریانشان در Edge می پردازد. این دو یک سرویس پیک دارند و به مارلین دختر خوانده بارت و یتیمی به نام دنزل که هر دو مبتلا به یک بیماری مرموز جدید به نام "ژئوستیگما" هستند، تمایل دارند. علاوه بر ژئوستیگما، فرزندان اج با خطر قریب‌الوقوع دیگری نیز روبرو هستند: گروهی از مردان قدرتمند که در حال ربودن بچه‌های آلوده برای اهداف نامعلوم هستند. کلود مصمم است که آنها را هم از دست ژئوستیگما و هم از دست اسیرکنندگانشان نجات دهد، اما به زودی متوجه می‌شود که این افراد با دشمن قدیمی‌اش سفیروث ارتباط دارند و تلاش او برای شکست دادن آنها، شیاطین درونی او را تحریک می‌کند. ابر و متحدانش که قبلا جهان را نجات داده بودند، باید دوباره گرد هم آیند تا بر این تهدیدات تهدیدآمیز غلبه کنند. در نهایت، موفقیت آنها به استحکام روابط دوستانه و پیوندهایی که ایجاد کرده اند بستگی دارد.