داستان در یک شهر معمولی ژاپنی، شهر فویوکی می گذرد. پنهان از جامعه، جنگ مرگباری در این شهر در جریان است. هفت جادوگر معروف به «ارباب» یک آشنای قدرتمند به نام «خدمت‌کاران» را احضار می‌کنند و همگی تا آخرین لحظه با یکدیگر می‌جنگند. گفته می شود که آخرین مورد به جام مقدس می رسد که به آنها یک آرزو را برآورده می کند. فقط تعداد کمی می دانند که این جنگ از چه زمانی آغاز شد و جام مقدس چیست، اما جنگ امسال دوباره شروع می شد.

شخصیت اصلی Emiya Shirou است که پدر و مادر خود را در آتش سوزی از دست داد و توسط مردی که خود را جادوگر می نامید به فرزندی پذیرفته شد. او با تحسین ناپدری خود، خود را به جادوگری آموزش داده است. با این حال، او هیچ استعدادی نداشت و به سختی می توانست از یک نوع جادو استفاده کند. ناپدری او قبلاً درگذشته است و امروز او یک جادوگر بدون هیچ مهارت و دانشی است. او درگیر جنگ جام مقدس می شود که به طور تصادفی صابر را که گفته می شود قوی ترین خدمتکار همه است احضار می کند...