مشاهده موجودات مرموز موسوم به "ارواح هولوگرام" در چند سال گذشته موضوع پرطرفدار شبکه های اجتماعی بوده است. بر اساس شنیده ها چندین نفر قربانی این شبح شده اند. آنهایی که شانس زنده ماندن از رویارویی خود با موجودات ماوراء الطبیعه را دارند، ادعا می کنند که آنها شبیه هولوگرام های معیوب هستند.

هیرو آمانوکاوا، دانش‌آموز مدرسه راهنمایی آکادمی هازاکورا معتقد است که این مشاهدات صرفاً یک افسانه شهری هستند. با این حال، با افزایش تعداد حوادث، روزی که پدرش ناگهان ناپدید شد، با ساعت‌های دیجیتال عجیب و غریب به عنوان تنها یادگار ناپدید شدن او به یاد او می‌افتد. چیزی که برای پدر هیرو اتفاق افتاد، مانند سایر مشاهدات، با منطق متعارف قابل توضیح نیست.

یک روز، زمانی که یکی از دانش‌آموزان در آکادمی مورد حمله یک روح هولوگرام قرار می‌گیرد، هیرو و دوستش کیوشیرو هیگاشیمی‌ترای تصمیم می‌گیرند تا موضوع را بررسی کنند. هیرو نمی داند که این تحقیق اولین قدم آنها در جهت کشف دنیای خطرناکی است که قبلاً برای بشر ناشناخته بود.