نینجاهای پرنده از سرزمین آسمان با انجام یک حمله غافلگیرکننده ویرانگر به دنبال انتقام از دشمن قدیمی خود کونوهاگاکوره هستند. ناروتو اوزوماکی علیرغم اشتیاق او برای پیوستن به مبارزه، توسط شینو، یک دکتر مرموز که برای نجات یک مصدوم به کمک او نیاز دارد، نگه داشته می شود. هنگام تحویل مرد مجروح به بیمارستان، ناروتو با آمارو برخورد غیرمنتظره‌ای می‌کند - جوانی طوفانی از روستای همسایه که ناامیدانه به دنبال کمک شینو می‌گردد. در همین حال، وقتی مهاجمان برای بازگرداندن نیروهای خود عقب‌نشینی می‌کنند، سوناده از فرصت استفاده می‌کند و یک تیم کوچک را اعزام می‌کند. از جمله سای، شیکامارو نارا و کاکاشی هاتاکه برای حمله به پایگاه خود. به طور همزمان، او به ناروتو، ساکورا هارونو و هیناتا هیوگا دستور می دهد تا شینو و آمارو را در سفرشان همراهی کنند. با این حال، در طول این مدت، اوروچیمارو نقشه های خاص خود را دارد: او به ساسوکه اوچیها دستور می دهد تا دکتر متخصص در تکنیک تناسخ را برای او بیاورد. همانطور که گروه اسکورت به طور تصادفی حقیقت شوم پشت حملات را کشف می کند، نقشه های آشفته ای به راه می افتد. اما حتی زمانی که ناروتو با یک اتحاد مجدد پیش بینی نشده مواجه می شود، در تلاش خود برای پایان دادن به جنگ و اثرات فاجعه بار آن تزلزل نمی کند.[نوشته شده توسط MAL Rewrite]